Снаружи Honda CR-Z 2016 выделяется новым передним бампером с иными секциями противотуманок и стильным спойлером, а также измененной решеткой радиатора и подретушированной оптикой.

Сзади ревизии подверглись бампер и фонари, плюс в линейке появились колесные диски нового дизайна. В салоне рестайлинговой Хонда CR-Z 2016 обращают на себя внимание появившийся на центральной консоли сенсорный экран аудиосистемы и подлокотник между передними креслами, который удалось разместить там за счет замены рычага стояночного тормоза на кнопку. Кроме того, автомобиль оснастили системой активного шумоподавления, а аудиосистема теперь может через динамики усиливать звук работы двигателя, создавая ощущение езды на более мощной машине, чем это есть на самом деле.